Safra Suyu, normal şartlarda midede çok az miktarda olur. Midede bulunan safra suyunun bir miktarı yemek borusu ile mide üstünde zararlı bir etki oluşturmamaktadır. Safra tuzlarının midedeki konsantrasyonu 0.05-0.5 miligram gibi ölçülerde farklılık göstermektedir. Bunlar ise toksik olmayan oranlardır. Reflü adı verilen mide safra suyu sofra tuzu seviyesinde genelde otuz miligram üzerinde olur. Yemek borusunda safra suyu oranı ise bu orandan biraz daha düşük seviyede on miligram civarında olur. Bu nedenden dolayı da toksik olmayan su burada safra tuzları yemek borusu epiteli içerisinde toksit konsantrasyonuna ulaşır. Mideye giden safra tuzları mide mukozası üstünde toksik etkileri yemek borusu ve midede mide asidinin meydana getirmiş olduğu zararın çok daha fazla şiddetlenmesine neden olur. Böyle bir durumda mide asit salgısını uyarmak amacı ile zarar almaya artık midede geri kaçan on iki parmak bağırsağı muhtevası içerisinde safra tuzları yanı sıra oldukça yüksek oranda bulunan pankreas enzimleri mide ile yemek borusunun mukozasında hazırlanmanın şiddetini daha çok artırır. Safra suyu midede çok fazla olduğunda mide asidini azalttığından dolayı reflüsü olan hasta kişilerin midede bakteri üremesini kolaylaştırmaktadır. Böyle bir durumda da hasta kişiler antibiyotik tedavisi ile tedavi olurlar.